نشأت أمانة الصندوق القومي لرعاية الطلاب بولاية غرب دارفور في العام 1994م والتي تهدف لرعاية وخدمة طلاب جامعة زالنجي، ثم انشطرت أمانة الولاية الى امانتين في العام 2014م بعد ان أصبحت جامعة زالنجي تتبع لولاية وسط دارفور وانشاء جامعة الجنينة والتي تتبع لولاية غرب دارفور، حيث يمتلك الصندوق مدينتين جامعتين هما (الزهراء) لسكن الطالبات والتي تسكن بها أكثر من 683 طالبة و(السلطان بحر الدين) والتي تسكن بها أكثر من557 طالب بالإضافة الى داخليات يقوم بإيجارها الصندوق لسكن الطالبات (3) داخليات تسكنها أكثر من 287 طالبة بناء على آخر الاحصائيات للعام الدراسي 2017م. ويقوم الصندوق برعايتهم جميعاً في مجالات الرعاية الاجتماعية والتسليف وتوفير احتياجاتهم وتهيئة الجو المناسب لسكنهم لينعكس ذلك في أداءهم وتحصيلهم العلمي.

هيكل الأمانة مكتمل ويعمل في شكل متناغم آخذين رؤية الصندوق سراجاً لتحقيق رسالتهأ